برای خرید آب مقطر باید از کیفیت آن مطلع شد . با توجه به روش های مختلف تقطیر ، کیفیت آنها با هم متفاوت خواهد بود . درصد ناخالصی در آب از عوامل مهم کیفیت آب مقطر است . عواملی که باعث سختی آب و ناخالصی در آن می شود به خاطر وجود املاح و مواد معدنی است که در آن موجود می باشد. یکی دیگر از عواملی که در کیفیت آب مقطر تاثیر گذار است ، بسته بندی آب مقطر است . اگر برای مدت زمان طولانی بخواهید از آب مقطر استفاده کنید . باید آنها را در گالن های نو و تمیز تهیه کنید. آب هایی که برای مصارف آزمایشگاهی و بهداشتی استفاده می شوند، در گالن های تمیز مدت زمان بالاتری کیفیت خود را حفظ می کنند.